21 aout 1797. Après une guerre sanglante entre deux organisations de l'ombre, ESP et Savior, le monde est partagé en deux entre l'Est Asiatique et l'Ouest Américain. Au milieu de ce chaos nait un nouvel Etat: Europa. C'est dans cette terre libre que, deux cents ans plus tard, est créé Arthus, un humain artificiel nommé "familier".
Alors que son créateur lui donne pour mission de se fondre dans la masse, cet objectif sera mis à mal par sa rencontre avec de Yuki Fuyuku, une Esper de Tokyo, membre de l'une de ces deux organisations.
A ses côtés, Arthus va être pris dans un engrenage qui le mènera à enquêter sur des phénomènes étranges et à faire la chasse aux cryptides. Mais dans ce quotidien insolite se cache un secret férocement gardé par les dirigeants de l'ombre. Un secret directement lié à la véritable raison de la présence d'Arthus en ce monde. Un secret remontant à l'origine de l'existence des mystérieux pouvoirs qui ont façonné le monde actuel.